Venne costruito nel 1293 e fu chiamato "palazzo nuovo del Comune" per contraddistinguerlo dal palazzo del Popolo.

 

La facciata, interamente in pietra bianca, è costituita da tre ordini: nel primo vi è un portico a due arcate a tutto sesto, nel secondo tre trifore cuspidate e nel terzo quattro trifore coperte da archi a tutto sesto. Fra il secondo ed il terzo ordine è sita una campana.

 

La scala d'accesso dalla piazza è in comune con quella del palazzo del Popolo.

 

I due edifici sono sede del municipio e del museo civico.

 

Il palazzo del Capitano è arretrato rispetto al palazzo del Popolo e ha un ponderoso porticato terreno, un primo piano con 3 eleganti trifore gotiche sormontate da cuspidi, e un secondo con 4 trifore. Una grande scala esterna (di fronte si vedono medioevali segnate nel muro) conduce al primo piano dei due palazzi:in cima ad essa, a sinistra, si accede alla Sala del Capitano del Popolo, con importanti avanzi di affreschi del XIII e XIV. A destra si va al salone del museo lapidario: vi si conservano numerosi oggetti provenienti dagli scavi condotti nella zona di Todi.